SMK Negeri 3 Bojonegoro atau Biasa disebut SMKN 3 BJN berdiri pada tanggal 01 Oktober 2002, Pada awalnya Sebelum Menjadi SMK Negeri 3 Bojonegoro Gedung Yang Berada di Jl Panglima Polim 49 Bojonegoro adalah Eks Balai Latihan Pendidikan Teknik (BLPT) Provinsi Jawa Timur. Akan tetapi karena lama terbengkalai Kosong Bertahun-tahun Tidak Berpenghuni Menyebabkan Banyak Bagian Gedung yang Rusak Tidak Terawat, Serta Tumbuhan-Tumbuhan Liar Yang Makin Tinggi Seperti Semak Belukar dan alang-alang,

Atas gagasan dari Bupati Bojonegoro Pada Saat itu Alm. Bapak Drs. H. Atlan, Mengupayakan agar lahan, bangunan dan peralatan Eks BLPT bisa digunakan dan dimanfaatkan, Maka dialih-fungsikanlah Gedung Eks BLPT menjadi SMK Negeri 3 Bojonegoro.

Secara resmi, SK Pendirian SMK Negeri 3 Bojonegoro baru turun pada tahun 2002 Melalui Surat Keputusan Bupati Bojonegoro Nomor : 304 A Tahun 2002 Tanggal 01 Oktober 2002 Tentang Pentapan Pendirian Sekolah Menengan Kejuruan (SMK) Negeri 3 Kabupaten Bojonegoro, Namun pendaftaran siswa baru dan proses kegiatan belajar mengajar sudah mulai dilaksanakan pada tahun 2001.

Pada tahun 2001 tersebut SMK Negeri 3 Bojonegoro hanya 2 memiliki program keahlian yaitu Teknik Las dan Teknik Pemesinan. 2 Program tersebut menjadi andalan sekolah ini. Dalam perkembangannya sampai dengan tahun 2018 ini berdasarkan Spektrum Kurikulum 2013 Revisi 2017 SMK Negeri 3 Bojonegoro memiliki 7 Kompetensi Keahlian diantaranya :

1. Teknik Pemesinan
2. Teknik Pengelasan
3. Analisis Pengujian Laboratorium
4. Teknik Kendaraan Ringan Otomotif
5. Teknik dan Bisnis Sepeda Motor
6. Multimedia
7. Otomatisasi dan Tata Kelola Perkantoran